氣功雖涉及許多學科，但與中醫學關係最密切。古代醫學家大多通曉養生之術，而氣功家也深知醫藥之理。一方面中醫基礎理論是組成氣功理論的重要部分，起著指導練功實踐的作用；另一方面，通過練功實踐獲得的實際感受，更可加深對機體陰陽、臟腑、經絡、精氣神、氣血及氣化等中醫基礎理論的理解。通過這種實踐與理論相互間的反復作用，氣功效應的中醫機制也逐漸被總結提煉出來：氣功主要通過調神練意的過程或方法，起到調整臟腑機能、增強氣化功能、發揮平秘陰陽、調和氣血、疏通經絡、培育真氣的作用，達到養生益智、祛病延年的功效。 

    1、平秘陰陽，調整臟腑：氣功對機體陰陽平衡具有廣泛的調節作用，可通過一定的功法，達到調節機體不同的功能狀態，使之呈現出“抑亢助虛”的雙向調節效應。比如，對高血壓和低血壓病人，氣功鍛煉可使兩類患者的血壓均趨向正常水平。同時，通過練功使心神安寧，“主明則下安，以此養生則壽”，協調臟腑的功能，使各臟腑各安其職，發揮各自應有的作用，從而使身體健康。如失眠多夢多屬“心腎不交”，通過練功使“水火既濟”，即導引心火下行，腎水上濟，臟腑功能得到調整，相應的病症也得到改善。 

    2、調和氣血，疏通經絡：氣功鍛煉時心靜體松，元氣充盛，使氣血得到充養，並促使氣血運行，疏通瘀阻的經絡，使五臟六腑、四肢百骸都得到充養。大多數練功人在鍛煉時會出現手足或身體某些部位發脹溫熱的感覺，或者感覺到一股暖流沿著一定路線移動。練功時肢體容積增加，區域血流相應變化等實驗結果也證實氣功確能調和氣血，疏通經絡。 

    3、培養真氣，增強氣化功能：氣功鍛煉通過調心凝神，調整臟腑功能，增強了氣化功能，培養了真氣，從而使“精”足、“氣”充、“神”旺、身體健康。人體的健康取決於元氣的充盛，元氣充盛則後天諸氣得以資助，從而臟腑充盛，心身健康。氣功鍛煉的治病強身作用，很大程度上是通過培補元氣而實現的。 《素問·上古天真論》所講：“恬淡虛無，真氣從之。精神內守，病安從來”，便是氣功培補元氣機理的精闢論述和概括。 

    ４、養生益智，祛病延年：氣功鍛煉時，通過寧心斂神、息息歸根、氣貫丹田的方法，通過日積月累的鍛煉，調整機體臟腑之間的陰陽平衡，使腎氣充實，元氣旺盛。氣足神自旺，神旺則頭腦清醒，步履穩健，體質增強。從而起到養生益智，祛病延年的作用。