十二經脈在腕踝關節附近各有一個重要經穴，是臟腑原氣經過和留止的部位，稱為“原穴”，又名“十二原”。原含本原，原氣之義。原氣，又稱元氣，真元，真氣之氣。 “原氣”禀受於先天，由先天之精所化生，發源於腎間命門，藏於臍下丹田，但又必須依賴後天之精氣的不斷滋養，才能有效的發揮其作用，它通過三焦通達全身，所有的髒腑經絡必須要得到原氣，才能發揮各自的功能，維持人體的正常生命活動。臟腑經絡之氣的產生也要根於原氣的滋養溫煦。因此，原氣的充沛是臟腑經絡功能旺盛的前提，是身體健康少病的原因。反之，如先天禀賦不足，或久病損傷原氣，或久病而後天失於濡養，則體弱多病。
    在治療方面，凡是臟腑疾病，都可以取相應的原穴來治療。如咳嗽，氣喘可取肺經的原穴太淵；腸鳴，泄瀉可取脾經原穴太白。在具體的應用上，可與某些特定穴配合使用，其方法如下：
    1．臟腑原穴相配：為五臟原穴與六腑原穴上下的配穴法。適用於內臟有病而症狀主要反映在體表器官的病變。從部位上講，內為陰，外為陽。陰經經穴主治偏重內臟疾患，陽經經穴主治偏重於體表器官疾患，在內臟有病主要反映在體表器官的情況下，取陰經原穴的同時需要配以陽經原穴以增強療效。其配穴原則是：少陰配少陽，太陰配太陽，厥陰配陽明。取上下肢相應，是陰陽經同氣相求之意。
    2．原絡相配，可分為表裡原絡相配及同經原絡相配，是取同一上肢或同一下肢的原絡相配的方法，表裡經原絡相配，適用於某些經有病，兼有表經或裡經的病症；具體方法是：某經的病症，先取該經的原穴為主，再配用有關表裡經的絡穴為輔，原為主，絡為客，故又稱之為主客原絡配穴法。如手太陰肺經發病，出現咳喘，氣急，兼見腹脹，腸鳴，大便失調等手陽明大腸經病候，可取肺經原穴太淵為主，輔以大腸經絡穴偏歷為客。
    3．原俞相配：即分別將本臟腑的原穴與相應的背俞穴相配。這是取原穴與俞穴在主治上存在的共性，以相互協同增強療效的一種配法對陰性病證(包括裡證、虛證、寒證)較為適宜。如取肺的背俞穴與肺經的原穴太淵治療氣虛喘咳等。
    4．原合相配：可分為表裡經原合相配，同經或異經原合相配等多種形式。表裡經原合相配，通常是取陰經(裡)原穴配以陽經(表)的合穴或下合穴。如脾胃失和所致的噁心、嘔吐、腹脹，可取脾經原穴太白，配胃經合穴足三里以健脾和胃，升清降濁。此為表裡雙治之法。而同經原合相配如手陽明大腸經原穴合各配穴曲池，為雙調氣血，清理上焦，善治頭目疼痛、牙齦腫痛。總之，原穴的配伍很靈活，其主治範圍十分廣泛。